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追加の 3 つの臨床テーブル: 医療機器 (ステント、ペースメーカー) 用の DEVICE_EXPOSURE、検体 (血液、組織) 用の SPECIMEN、臨床メモおよび NLP 処理用の NOTE および NOTE_NLP。

はじめに

この記事では、DEVICE_EXPOSURE (埋め込み型/患者装着型医療機器)、SPECIMEN (テストに使用される標本)、および NOTE / NOTE_NLP (自由記述の臨床メモ) という 3 つの追加臨床テーブルを紹介します。状態/薬剤/処置ほど一般的ではありませんが、研究ではますます重要になっています。

1. DEVICE_EXPOSURE — 医療機器

＃＃＃１．１．テーブル構造

コラム	タイプ	必須	説明
`device_exposure_id`	整数	✅PK	固有の ID
`person_id`	整数	✅FK	患者
`device_concept_id`	整数	✅	スタンダードコンセプト
`device_exposure_start_date`	日付	✅	開始日
`device_exposure_start_datetime`	日時
`device_exposure_end_date`	日付		有効期限/削除日
`device_exposure_end_datetime`	日時
`device_type_concept_id`	整数	✅	データソース
`unique_device_id`	VARCHAR(255)		固有のデバイス識別子 (UDI)
`production_id`	VARCHAR(255)		⭐ 新しい CDM 5.4
`quantity`	整数		数量
`provider_id`	整数	FK	医師
`visit_occurrence_id`	整数	FK	訪問
`visit_detail_id`	整数	FK
`device_source_value`	VARCHAR(50)
`device_source_concept_id`	整数
`unit_concept_id`	整数		⭐ 新しい CDM 5.4
`unit_source_value`	VARCHAR(50)		⭐ 新しい CDM 5.4
`unit_source_concept_id`	整数		⭐ 新しい CDM 5.4

＃＃＃１．２．たとえば

設備	コンセプト	例
冠状動脈ステント	4138390	介入後のステント留置
ペースメーカー	4051938	ペースメーカー
気管内チューブ	4097216	手術中の挿管
眼鏡	4175440	メガネを処方する
補聴器	4023396	補聴器レベル
鍼治療0	東洋医学の機器 (まだマッピングされていません)

-- Đặt stent mạch vành
INSERT INTO device_exposure (
    device_exposure_id, person_id, device_concept_id,
    device_exposure_start_date,
    device_type_concept_id,
    unique_device_id, quantity,
    provider_id, visit_occurrence_id,
    device_source_value
) VALUES (
    140001, 100001, 4138390,
    '2024-06-15',
    32817,
    '(01)00844588003288(17)141120(10)A213B1',
    2,                            -- 2 stent
    5001, 50001,
    'STENT_CORONARY'
);

＃＃＃１．３． CDM 5.4 —production_id

5.4 の新機能: production_id から分離する unique_device_id、製造識別子（シリアル番号、ロット番号）に使用されます。

2. 検体 — 患者のサンプル

＃＃＃２．１．テーブル構造

コラム	タイプ	必須	説明
`specimen_id`	整数	✅PK	固有の ID
`person_id`	整数	✅FK	患者
`specimen_concept_id`	整数	✅	サンプルタイプ (SNOMED)
`specimen_type_concept_id`	整数	✅	データソース
`specimen_date`	日付	✅	サンプリング日
`specimen_datetime`	日時
`quantity`	フロート		サンプル数量
`unit_concept_id`	整数		単位 (mL、g...)
`anatomic_site_concept_id`	整数		サンプリング場所
`disease_status_concept_id`	整数		病状
`specimen_source_id`	VARCHAR(50)		オリジナルのバーコード
`specimen_source_value`	VARCHAR(50)		オリジナルモデルのタイプ
`unit_source_value`	VARCHAR(50)		オリジナルユニット
`anatomic_site_source_value`	VARCHAR(50)		元の場所
`disease_status_source_value`	VARCHAR(50)		元の状態

＃＃＃２．２．人気のモデルタイプ

標本コンセプトID	サンプルの種類	ベトナム語
4045667	血液検体	血液サンプル
4048506	尿検体	尿
4002890	血清検体	血清
4219166	組織標本	組織サンプル
4045666	喀痰標本	ダム
4260640	脳脊髄液	脳脊髄液
4000626	骨髄骨髄

＃＃＃２．３．試料→測定リンク

-- Mẫu máu lấy ngày 15/6
INSERT INTO specimen VALUES (
    150001, 100001, 4045667,      -- Blood specimen
    32817, '2024-06-15', NULL,
    5, 8587,                      -- 5 mL
    4236402,                      -- Antecubital vein
    NULL, 'BARCODE_123456',
    'MAU_MAU', 'mL', 'tinh_mach_khuu_tay', NULL
);

-- Xét nghiệm Glucose từ mẫu máu này
-- (liên kết qua person_id + measurement_date + logic ETL)

注: CDM 5.4 では、SPECIMEN には MEASUREMENT への直接の FK がありません。リンクは通常、person_id + date または FACT_RELATIONSHIP を介して行われます。

3. 注意 — 臨床メモ

＃＃＃３．１．注テーブルの構造

コラム	タイプ	必須	説明
`note_id`	整数	✅PK	固有の ID
`person_id`	整数	✅FK	患者
`note_date`	日付	✅	メモの日付
`note_datetime`	日時
`note_type_concept_id`	整数	✅	ノートの種類
`note_class_concept_id`	整数	✅	分類
`note_title`	VARCHAR(250)		タイトル
`note_text`	クロブ	✅	コンテンツ
`encoding_concept_id`	整数	✅	エンコーディング (UTF-8)
`language_concept_id`	整数	✅	言語
`provider_id`	整数	FK	医師はこう書いています
`visit_occurrence_id`	整数	FK	訪問
`visit_detail_id`	整数	FK
`note_source_value`	VARCHAR(50)
`note_event_id`	ビッグINT		⭐ CDM 5.4
`note_event_field_concept_id`	整数		⭐ CDM 5.4

＃＃＃３．２．共通の note_class_concept_id

コンセプトID	ノートクラス	ベトナム語
44814637	退院概要	退院概要
44814638	救急科のメモ	緊急時の注意事項
44814639	入院中のメモ	搭乗メモ
44814640	外来メモ	外来メモ
44814641	病理レポート	病理学的結果
44814642	放射線科レポート	X線/CT結果
44814643	手術記録	手術記録

＃＃＃３．３．たとえば

-- Tóm tắt xuất viện
INSERT INTO note (
    note_id, person_id, note_date,
    note_type_concept_id, note_class_concept_id,
    note_title, note_text,
    encoding_concept_id, language_concept_id,
    provider_id, visit_occurrence_id
) VALUES (
    160001, 100001, '2024-06-20',
    32817,                            -- EHR
    44814637,                         -- Discharge summary
    'TÓM TẮT XUẤT VIỆN',
    'Bệnh nhân nam, 55 tuổi, nhập viện vì đau ngực. '
    || 'Chẩn đoán: Nhồi máu cơ tim cấp. '
    || 'Đã can thiệp mạch vành, đặt 2 stent. '
    || 'Xuất viện ngày 20/06/2024 với đơn thuốc: '
    || 'Aspirin 81mg, Clopidogrel 75mg, Atorvastatin 40mg. '
    || 'Tái khám sau 1 tháng.',
    32678,                            -- UTF-8
    4181730,                          -- Vietnamese
    5001, 50001
);

4.NOTE_NLP — NLP 処理の結果

コラム	タイプ	必須	説明
`note_nlp_id`	ビッグINT	✅PK	ID
`note_id`	整数	✅FK	オリジナルノート
`section_concept_id`	整数		セクション (HPI、評価...)
`snippet`	VARCHAR(250)		抜粋テキスト
`offset`	VARCHAR(50)		メモ内の場所
`lexical_variant`	VARCHAR(250)	✅	ルート単語/フレーズ
`note_nlp_concept_id`	整数	✅	コンセプトの発見
`note_nlp_source_concept_id`	整数
`nlp_system`	VARCHAR(250)		名前 NLP ツール
`nlp_date`	日付	✅	NLP 実行日
`nlp_datetime`	日時
`term_exists`	VARCHAR(1)		Y/N — 確認または拒否
`term_temporal`	VARCHAR(50)		過去/現在/未来
`term_modifiers`	VARCHAR(2000)		修飾子 (否定、ファミリー...)

-- NLP phát hiện "Nhồi máu cơ tim" từ tóm tắt xuất viện
INSERT INTO note_nlp (
    note_nlp_id, note_id,
    snippet, offset, lexical_variant,
    note_nlp_concept_id,
    nlp_system, nlp_date,
    term_exists, term_temporal
) VALUES (
    170001, 160001,
    'Chẩn đoán: Nhồi máu cơ tim cấp',
    '120-153',
    'nhồi máu cơ tim cấp',
    4329847,                          -- SNOMED: AMI
    'cTAKES-VN', '2024-07-01',
    'Y',                              -- Có (không phải negation)
    'Present'                         -- Hiện tại
);

5. どのテーブルをいつ使用するか?

  Dữ liệu gốc
       │
       ├── Thiết bị gắn/cấy trên BN ──→ DEVICE_EXPOSURE
       │   (stent, pacemaker, kính)
       │
       ├── Mẫu bệnh phẩm ──────────→ SPECIMEN
       │   (máu, nước tiểu, mô)
       │
       ├── Văn bản tự do ───────────→ NOTE
       │   (tóm tắt xuất viện,
       │    biên bản phẫu thuật)
       │
       └── Kết quả NLP từ NOTE ─────→ NOTE_NLP
           (concepts phát hiện tự động)

概要

DEVICE_EXPOSURE: 埋め込まれた/取り付けられた医療機器、トレースに UDI を使用します
検体: 患者サンプル、測定に間接的にリンクされます。
注意: 自由テキストの臨床ノート、ベトナム語サポート
NOTE_NLP: NLP 分析結果、自動コンセプト検出
CDM 5.4 が追加されました production_id (デバイス)、 note_event_id (注)

次の記事: DEATH、EPISODE、EPISODE_EVENT — 特別なイベント。

レッスン 12: DEVICE_EXPOSURE、検体、メモ