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记录测试结果、生命体征和临床测量结果。 value_as_number / value_as_concept_id、operator_concept_id、unit_concept_id、range_low / range_high、LOINC 詞彙、measurement_event_id 新 CDM 5.4。

醫學測試和測量儀表板

簡介

測量是所有實驗室結果、生命徵象和臨床測量的記錄－任何具有可測量值（數字或類別）的數據。這是大多數 OMOP 資料庫中最大的表，通常佔總記錄的 50% 以上，因為每次測試都會建立許多行（例如：具有 20 個指標的血液測試表 = 20 條記錄）。

1.表結構

專欄	類型	必填	說明
`measurement_id`	整數	✅ PK	唯一ID
`person_id`	整數	✅ FK	病人
`measurement_concept_id`	整數	✅	標準概念（LOINC）
`measurement_date`	日期	✅	考試日期
`measurement_datetime`	日期時間		日期與時間
`measurement_time`	VARCHAR(10)		現在（遺留）
`measurement_type_concept_id`	整數	✅	資料來源
`operator_concept_id`	整數		運算子（<, >,=, <=, >=)
`value_as_number`	浮動		數值
`value_as_concept_id`	整數		類別值
`unit_concept_id`	整數		單位（UCUM）
`range_low`	浮動		正常下限
`range_high`	浮動		正常上限
`provider_id`	整數	氟克	醫生囑咐
`visit_occurrence_id`	整數	氟克	相關訪問
`visit_detail_id`	整數	氟克	瀏覽詳情
`measurement_source_value`	VARCHAR(50)		原始測試程式碼
`measurement_source_concept_id`	整數		原創概念
`unit_source_value`	VARCHAR(50)		原單位
`unit_source_concept_id`	整數		原始單位概念
`value_source_value`	VARCHAR(50)		原值
`measurement_event_id`	大智		⭐ 新CDM 5.4
`meas_event_field_concept_id`	整數		⭐ 新CDM 5.4

2. value_as_number 與 value_as_concept_id

2.1。 NUMBER 結果 → value_as_number

-- Glucose máu: 6.5 mmol/L
INSERT INTO measurement VALUES (
    110001, 100001, 3004501,         -- LOINC: Glucose [Mass/volume] in Blood
    '2024-06-15', NULL, NULL,
    32817,                            -- EHR
    4172703,                          -- = (equals)
    6.5,                              -- value_as_number
    NULL,                             -- no concept value
    8753,                             -- UCUM: mmol/L
    3.9, 6.1,                         -- range: 3.9-6.1
    5001, 50001, NULL,
    'GLU', 0, 'mmol/L', 0,
    '6.5', NULL, NULL
);

2.2。結果類別 → value_as_concept_id

-- Xét nghiệm nhóm máu: O
INSERT INTO measurement VALUES (
    110002, 100001, 3003694,         -- LOINC: ABO group [Type] in Blood
    '2024-06-15', NULL, NULL,
    32817,                            -- EHR
    NULL,                             -- no operator
    NULL,                             -- no numeric value
    36308332,                         -- Concept: Blood group O
    NULL,                             -- no unit
    NULL, NULL,                       -- no range
    5001, 50001, NULL,
    'BLOOD_TYPE', 0, NULL, 0,
    'O', NULL, NULL
);

2.3。評選規則

結果	值作為數字	value_as_concept_id
“6.5 毫摩爾/公升”	6.5	6.5 空
「積極」	空	4181412（正）
「負」	空	4132135（負）
「O型血」	空	36308332
> 100"	100	100 NULL + 運算子 = >
「正常」	空	4069590（普通）

3.operator_concept_id — 比較運算子

當結果不正確時使用（例如：“< 0.5", "> 100”）。

概念 ID	操作員	意義
4171756	4171756 4171756 <	降低
4171754	4171754 <=	小於或等於
4172703	4172703 =	等於（預設）
4172704	>=	高於或等於
4172702	4172702 >	更高

-- Kết quả HBsAg: < 0.05 (dưới ngưỡng phát hiện)
INSERT INTO measurement (
    measurement_id, person_id, measurement_concept_id,
    measurement_date, measurement_type_concept_id,
    operator_concept_id, value_as_number,
    unit_concept_id, measurement_source_value
) VALUES (
    110003, 100001, 3013721,         -- LOINC: HBsAg
    '2024-06-15', 32817,
    4171756,                          -- operator: <
    0.05,                             -- value
    8647,                             -- IU/mL
    'HBSAG'
);

4. LOINC — 詞彙測試

4.1。 LOINC結構

LOINC Code = Component : Property : Time : System : Scale : Method
VD: 2345-7 = Glucose : MCnc : Pt : Ser/Plas : Qn

  Component  = Glucose         (đo gì)
  Property   = MCnc            (mass concentration)
  Time       = Pt              (point in time)
  System     = Ser/Plas        (huyết thanh/huyết tương)
  Scale      = Qn              (quantitative - số)

4.2。 LOINC很受歡迎

LOINC 代碼	概念 ID	姓名	越南
2345-7	2345-7 3004501	血清中的葡萄糖[質量/體積]	血糖
4548-4	3034639	3034639糖化血紅素	糖化血紅素
2160-0	2160-0 3016723	血清肌酸酐	血肌酸酐
6768-6	3006923	血清中的 ALT	SGPT
33914-3	33914-3 3027018	GFR 估計值	腎小球濾過率
718-7	718-7 3000963	血紅素	血紅素
26515-7	26515-7 3010813	血小板	血小板
2093-3	2093-3 3027114	總膽固醇	總膽固醇

5.unit_concept_id — UCUM 單元

概念 ID	UCUM 代碼	單位
8840	毫克/分升	毫克每分升
8753	毫摩爾/公升	毫摩爾每公升
8647	國際單位/毫升	國際單位每毫升
8554	%	百分比
9529	9529公斤/平方公尺	體重指數
8876	毫米[汞]	毫米汞柱
8582	/uL	每微升（血球）
8845	毫克/公升	毫克每公升

重要： 相同的測試但不同的單位 → 不同的值。例如：葡萄糖 100 mg/dL = 5.6 mmol/L。 ETL必須標準化單位！

6.measurement_event_id — CDM 5.4 的新增功能

允許將測量連結到任何其他事件。

  ┌──────────────────────────────┐
  │     MEASUREMENT              │
  │  "Lab: BUN = 35 mg/dL"      │
  │  measurement_event_id = 70001│
  │  meas_event_field_concept_id │
  │  = 1147127                   │──→ condition_occurrence
  │     (condition_occurrence_id)│     .condition_occurrence_id
  └──────────────────────────────┘     = 70001

應用：將測試與請求該測試的特定診斷或程序相關聯。

-- Xét nghiệm BUN liên quan đến chẩn đoán suy thận
INSERT INTO measurement (
    measurement_id, person_id, measurement_concept_id,
    measurement_date, measurement_type_concept_id,
    value_as_number, unit_concept_id,
    measurement_event_id,
    meas_event_field_concept_id
) VALUES (
    110010, 100001, 3013682,         -- LOINC: BUN
    '2024-06-15', 32817,
    35, 8840,                         -- 35 mg/dL
    70001,                            -- Liên kết condition_occurrence_id = 70001
    1147127                           -- Field = condition_occurrence.condition_occurrence_id
);

7. ETL 測試 VN

7.1。常見問題

問題	解決方案
BV內部考試代碼	透過 SOURCE_TO_CONCEPT_MAP → LOINC
文字結果「陽性」	映射到 value_as_concept_id
結果"< 0.5"	分割運算子 + value_as_number
非標機組	UCUM 地圖
範圍因實驗室而異	從機器/實驗室取得範圍，輸入 range_low/range_high
20個指標的測試表=1行	分為20筆測量記錄

7.2. SQL ETL

-- Mỗi chỉ số xét nghiệm = 1 record MEASUREMENT
SELECT
    ROW_NUMBER() OVER() AS measurement_id,
    pm.person_id,
    COALESCE(stcm.target_concept_id, 0) AS measurement_concept_id,
    xn.ngay_xetnghiem AS measurement_date,
    32817 AS measurement_type_concept_id,
    -- Parse operator từ giá trị gốc
    CASE
        WHEN xn.gia_tri LIKE '<%' THEN 4171756    -- <
        WHEN xn.gia_tri LIKE '>%' 那麼 4172702 -->
        其他 4172703 -- =
    END AS 運算子_概念_id，
    -- 從值中解析數字
    案例
        當 xn.price ~ '^[<>]?[0-9.]+'
        則 REGEXP_REPLACE(xn.value, '[^0-9.]', '', 'g')::FLOAT
        否則為空
    END AS value_as_number,
    -- 類別結果
    CASE xn 值
        當「積極」時，那麼 4181412 -- 積極
        當「陰性」時，則 4132135 -- 陰性
        當「正常」時，則 4069590 -- 正常
        否則為空
    END AS value_as_concept_id,
    COALESCE(u.target_concept_id, 0) AS unit_concept_id,
    xn.gioi_han_duoi AS range_low,
    xn.gioi_han_tren AS range_high,
    xn.ma_xetnghiem AS 測量來源值，
    xn.don_vi_goc AS 單位來源值，
    xn.value AS value_source_value
來自 xetnghiem_his xn
JOIN person_mapping pm ON xn.ma_bn = pm.source_id
左連接 source_to_concept_map stcm
    ON xn.ma_xetnghiem = stcm.source_code
    AND stcm.source_vocabulary_id = 'VN_LAB'
左連接 source_to_concept_map u
    ON xn.don_vi_goc = u.source_code
    AND u.source_vocabulary_id = 'VN_UNIT';

8. 測量生命徵象

生命徵象	洛因克	概念 ID	單位
收縮壓	8480-6	8480-6 3004249	毫米汞柱
舒張壓	8462-4	3012888	毫米汞柱
心率	8867-4	3027018	/分鐘
溫度	8310-5	3020891	℃
SpO2	59408-5	40762499	%
重量	29463-7	29463-7 3025315	公斤
身高	8302-2	3036277	3036277公分
BMI	39156-5	3038553	kg/m²

-- 記錄生命徵象：血壓 130/85、NT 80、體溫 37.2、SpO2 97%
插入測量（measurement_id、person_id、measurement_concept_id、
    測量日期、測量類型概念 ID、
    value_as_number、unit_concept_id、measurement_source_value）
價值觀
    (120001, 100001, 3004249, '2024-06-15', 32817, 130, 8876, 'SBP'),
    (120002, 100001, 3012888, '2024-06-15', 32817, 85, 8876, 'DBP'),
    (120003, 100001, 3027018, '2024-06-15', 32817, 80, 8541, '人力資源'),
    (120004, 100001, 3020891, '2024-06-15', 32817, 37.2, 586323, '暫時'),
    (120005, 100001, 40762499, '2024-06-15', 32817, 97, 8554, 'SPO2');

9. SQL分析

-- HbA1c 在人群中的分佈
選擇
    案例
        當 m.value_as_number 時 < 5.7 THEN 'Bình thường (<5.7%)'
        WHEN m.value_as_number BETWEEN 5.7 AND 6.4 THEN 'Tiền ĐTĐ (5.7-6.4%)'
        WHEN m.value_as_number >= 6.5 那麼“糖尿病 (>=6.5%)”
    結束為 hba1c_group,
    COUNT(DISTINCT m.person_id) AS 患者，
    ROUND(AVG(m.value_as_number), 2) AS avg_hba1c
FROM 測量 m
其中 m.measurement_concept_id = 3034639 -- HbA1c
  AND m.value_as_number 不為空
  AND m.value_as_number BETWEEN 2 AND 20 -- 輸入異常值
按 hba1c_group 分組
按 hba1c_group 排序；

-- HbA1c 隨時間變化的趨勢（1 名患者）
選擇
    m.測量日期，
    m.value_as_number AS hba1c，
    案例
        當 m.value_as_number 時 < 7.0 THEN '✅ Kiểm soát tốt'
        ELSE '⚠️ Cần cải thiện'
    END AS status
FROM measurement m
WHERE m.person_id = 100001
  AND m.measurement_concept_id = 3034639
ORDER BY m.measurement_date;

-- Xét nghiệm bất thường (ngoài range)
SELECT
    c.concept_name AS test_name,
    COUNT(*) AS abnormal_count,
    COUNT(DISTINCT m.person_id) AS patients
FROM measurement m
JOIN concept c ON m.measurement_concept_id = c.concept_id
WHERE m.value_as_number IS NOT NULL
  AND (m.value_as_number < m.range_low
       OR m.value_as_number > m.range_high)
  且 m.range_low 不為空
  AND m.range_high 不為空
按 c.concept_name 分組
ORDER BY異常計數 DESC
限制 10；

總結

測量 = 測試 + 生命徵象 + 所有測量值
兩種結果類型：value_as_number（數字）或value_as_concept_id（類別）
operator_concept_id 給出結果“<”或“>”
unit_concept_id 使用 UCUM，measurement_concept_id 使用 LOINC
range_low / range_high 為正常參考值
CDM 5.4：measurement_event_id 將測試與另一個事件相關聯

下一篇文章： 觀察—專門表格未涵蓋的臨床事件。

第 10 課：測量 — 測驗與測量

簡介