┌─────────────────────────────────────────────────────┐
│ standard_concept = 'S' (Standard) │
│ → Concept "chính thống" dùng trong *_concept_id │
│ → VD: SNOMED 201826 "Type 2 diabetes mellitus" │
│ → Dùng cho condition_concept_id │
└──────────────────────┬──────────────────────────────┘
│ Maps to (nguồn → đích)
┌──────────────────────┴──────────────────────────────┐
│ standard_concept = NULL (Non-standard / Source) │
│ → Concept nguồn từ ICD, CPT4, ATC... │
│ → VD: ICD10CM 45591837 "E11 - Type 2 DM" │
│ → Dùng cho *_source_concept_id │
└─────────────────────────────────────────────────────┘
┌─────────────────────────────────────────────────────┐
│ standard_concept = 'C' (Classification) │
│ → Concept dùng cho phân cấp / ancestor │
│ → VD: MedDRA PT "Diabetes mellitus" │
└─────────────────────────────────────────────────────┘
1.3。 domain_id — 標識目標表
網域名稱 ID
清潔發展機製表
範例
條件
CONDITION_OCCURRENCE
條件發生疾病、症狀
藥品
藥物暴露
醫學
程式
PROCEDURE_OCCURRENCE
流程發生提示
測量
測量
測試
觀察
觀察
致謝
設備
設備曝光
設備
規格解剖網站
樣本
取樣地點
訪問
訪問發生次數
類型訪問
型別概念
*_type_concept_id
資料來源
性別
人物
性別
比賽
人物
比賽
單位
測量單位
單位
路線
藥物暴露.route
給藥途徑
2. 詞彙表
2.1。結構
專欄
類型
說明
vocabulary_id
VARCHAR(20)
PK－ID詞彙
vocabulary_name
VARCHAR(255)
全名
vocabulary_reference
VARCHAR(255)
參考網址
vocabulary_version
VARCHAR(255)
版本
vocabulary_concept_id
整數
FK→代表概念
2.2。熱門詞彙
詞彙_id
名稱
主域
角色
SNOMED
SNOMED-CT
條件、程序、觀察
Standard for clinical use
RxNorm
RxNorm
藥品
醫學標準
LOINC
洛因克
測量
測試標準
ICD10CM
ICD-10-CM
條件
Source concept diagnosis
ICD10PCS
ICD-10-PCS
程式
來源概念提示
CPT4
CPT-4
程式、測量
來源計費代碼
空中交通管制
空中交通管制
藥品
Classification of drugs
UCUM
UCUM
單位
計量單位
性別
OMOP 性別
性別
性別
比賽
比賽
比賽
比賽
CVX
疫苗
藥品
疫苗代碼
3. 在 Athena 上尋找 Concept
3.1。尋找步驟
1. Vào athena.ohdsi.org
2. Gõ từ khóa: "Type 2 diabetes"
3. Filter:
- Standard Concept: Standard ✓
- Domain: Condition ✓
- Vocabulary: SNOMED ✓
4. Kết quả:
concept_id: 201826
concept_name: Type 2 diabetes mellitus
vocabulary_id: SNOMED
concept_code: 44054006
standard_concept: S
domain_id: Condition
3.2。 SQL查詢
-- Tìm Standard Concept cho "tiểu đường type 2"
SELECT concept_id, concept_name, vocabulary_id,
domain_id, standard_concept, concept_code
FROM concept
WHERE LOWER(concept_name) LIKE '%type 2 diabetes%'
AND standard_concept = 'S'
AND domain_id = 'Condition'
ORDER BY concept_name;
-- Tìm Source Concept (ICD-10) mapping đến Standard
SELECT
c_src.concept_id AS source_concept_id,
c_src.concept_code AS icd10_code,
c_src.concept_name AS icd10_name,
c_std.concept_id AS standard_concept_id,
c_std.concept_name AS standard_name,
c_std.vocabulary_id AS standard_vocab
FROM concept c_src
JOIN concept_relationship cr
ON c_src.concept_id = cr.concept_id_1
AND cr.relationship_id = 'Maps to'
JOIN concept c_std
ON cr.concept_id_2 = c_std.concept_id
AND c_std.standard_concept = 'S'
WHERE c_src.concept_code = 'E11'
AND c_src.vocabulary_id = 'ICD10CM';
4.concept_class_id — 詞彙分類
4.1。斯諾梅德
概念類別 ID
意義
範例
臨床結果
疾病、症狀
2 型 DM
程序
提示
闌尾切除術
車身結構
車身結構
肝臟
物質
品質
葡萄糖
可觀察實體
測量數量
血壓
限定值
附加價值
嚴重
4.2。接收標準
概念類別 ID
水平
範例
成分（印度）
活性成分
二甲雙胍
Clinical Drug Form (CDF)
HC+劑型
二甲雙胍口服錠
臨床藥物（CD）
HC + 劑量 + 形式
二甲雙胍 500 毫克片劑
品牌藥 (BD)
商品名稱
格華止 500 毫克片劑
Clinical Drug Comp (CDC)
HC + 劑量
二甲雙胍 500 毫克
品牌名稱 (BN)
商品名稱
噬菌體
劑型 (DF)
劑型
口服錠劑
5. 域表
專欄
類型
說明
domain_id
VARCHAR(20)
PK
domain_name
VARCHAR(255)
網域名稱
domain_concept_id
整數
FK → 概念
6. CONCEPT_CLASS table
專欄
類型
說明
concept_class_id
VARCHAR(20)
PK
concept_class_name
VARCHAR(255)
班級名稱
concept_class_concept_id
整數
FK → 概念
7. concept_id = 0 — Special meaning
概念
意義
何時使用
概念 ID = 0
“沒有匹配的概念”
無法映射
概念名稱
「沒有符合的概念」
域名 ID
空
詞彙_id
“無”
-- Kiểm tra % records không map được
SELECT
'condition_occurrence' AS table_name,
COUNT(*) AS total_records,
SUM(CASE WHEN condition_concept_id = 0 THEN 1 ELSE 0 END) AS unmapped,
ROUND(SUM(CASE WHEN condition_concept_id = 0 THEN 1 ELSE 0 END) * 100.0
/ COUNT(*), 1) AS unmapped_pct
FROM condition_occurrence
UNION ALL
SELECT 'drug_exposure', COUNT(*),
SUM(CASE WHEN drug_concept_id = 0 THEN 1 ELSE 0 END),
ROUND(SUM(CASE WHEN drug_concept_id = 0 THEN 1 ELSE 0 END) * 100.0
/ COUNT(*), 1)
FROM drug_exposure
UNION ALL
SELECT 'measurement', COUNT(*),
SUM(CASE WHEN measurement_concept_id = 0 THEN 1 ELSE 0 END),
ROUND(SUM(CASE WHEN measurement_concept_id = 0 THEN 1 ELSE 0 END) * 100.0
/ COUNT(*), 1)
FROM measurement;
