課程介紹
OHDSI 和 OMOP CDM 是關於世界上最大的觀察健康數據分析生態系統的綜合課程。
為什麼選擇 OHDSI?
每個醫院和衛生系統的醫療數據都以不同的格式存儲,這使得多中心研究幾乎不可能。 OHDSI(發音:「Odyssey」)透過將資料標準化為 OMOP 通用資料模型並提供一套統一的分析工具來解決此問題。
你會學到什麼?
Hệ sinh thái OHDSI
├── Standardized Vocabularies (Athena)
├── ETL Tools
│ ├── WhiteRabbit — Khảo sát dữ liệu nguồn
│ ├── Rabbit-in-a-Hat — Thiết kế ETL mapping
│ └── Usagi — Mapping mã nguồn → Standard Concepts
├── OMOP CDM Database (PostgreSQL)
├── WebAPI — Backend REST API
├── ATLAS — Web-based Analytics Platform
│ ├── Concept Sets & Cohort Definitions
│ ├── Characterization & Incidence Rates
│ ├── Population-Level Estimation
│ └── Patient-Level Prediction
├── Data Quality
│ ├── ACHILLES — Data Profiling
│ └── Data Quality Dashboard — 1,500+ Quality Checks
└── HADES — R Packages cho Observational Research
先決條件
- 基本 SQL(選擇、連線、分組依據)
- 對資料庫有基本的了解(PostgreSQL優先)
- Docker 基礎(docker run、docker-compose)
- 基本 R(針對 HADES 部分)— 不需要
- 不需要深入的醫學知識