Chuyển đến nội dung chính
Trung cấp

OHDSI & OMOP CDM — Phân tích Dữ liệu Y tế Toàn diện

Series toàn diện về hệ sinh thái OHDSI (Observational Health Data Sciences and Informatics) và OMOP Common Data Model — từ tổng quan nền tảng, chuẩn hóa Standardized Vocabularies (Athena), ETL dữ liệu y tế (WhiteRabbit, Rabbit-in-a-Hat, Usagi), triển khai OMOP CDM trên PostgreSQL, cài đặt WebAPI và ATLAS, đến phân tích dữ liệu lâm sàng (Cohort Definitions, Characterization, Incidence Rates, Population-Level Estimation, Patient-Level Prediction), đánh giá chất lượng dữ liệu (ACHILLES, Data Quality Dashboard), HADES R packages cho nghiên cứu quan sát, và triển khai OHDSI stack trên Docker/Kubernetes cho Network Studies đa trung tâm.

DUY TRANDuy Tran
17 bài học
50 giờ
OHDSI & OMOP CDM — Phân tích Dữ liệu Y tế Toàn diện

Nội dung series

6 phần · 17 bài học

Giới thiệu khóa học

OHDSI & OMOP CDM là khóa học toàn diện về hệ sinh thái phân tích dữ liệu y tế quan sát lớn nhất thế giới.

Tại sao OHDSI?

Dữ liệu y tế tại mỗi bệnh viện, hệ thống y tế được lưu trữ trong các định dạng khác nhau — khiến việc nghiên cứu đa trung tâm gần như không thể. OHDSI (phát âm: "Odyssey") giải quyết vấn đề này bằng cách chuẩn hóa dữ liệu vào OMOP Common Data Model và cung cấp bộ công cụ phân tích thống nhất.

Bạn sẽ học gì?

Hệ sinh thái OHDSI
├── Standardized Vocabularies (Athena)
├── ETL Tools
│   ├── WhiteRabbit — Khảo sát dữ liệu nguồn
│   ├── Rabbit-in-a-Hat — Thiết kế ETL mapping
│   └── Usagi — Mapping mã nguồn → Standard Concepts
├── OMOP CDM Database (PostgreSQL)
├── WebAPI — Backend REST API
├── ATLAS — Web-based Analytics Platform
│   ├── Concept Sets & Cohort Definitions
│   ├── Characterization & Incidence Rates
│   ├── Population-Level Estimation
│   └── Patient-Level Prediction
├── Data Quality
│   ├── ACHILLES — Data Profiling
│   └── Data Quality Dashboard — 1,500+ Quality Checks
└── HADES — R Packages cho Observational Research

Yêu cầu tiên quyết

  • SQL cơ bản (SELECT, JOIN, GROUP BY)
  • Hiểu biết cơ bản về database (PostgreSQL ưu tiên)
  • Docker cơ bản (docker run, docker-compose)
  • R cơ bản (cho phần HADES) — không bắt buộc
  • Không yêu cầu kiến thức y khoa chuyên sâu
DUY TRAN
Tác giả

DUY TRAN

Pursuing an AI-first mindset and intelligent system architecture. I build solutions by combining technology, creativity, and the ability to see structure in chaos — the foundation for becoming a Solution Architect.

Bình luận